Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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