Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms