Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smc6Q924W5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms