Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms