Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfcdQ922L6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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