Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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