Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Afg3l1Q920A7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Afg3l1Q920A7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Afg3l1Q920A7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Afg3l1Q920A7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Afg3l1Q920A7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Afg3l1Q920A7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms