Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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