Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rab29Q91YQ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rab29Q91YQ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rab29Q91YQ1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rab29Q91YQ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab29Q91YQ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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