Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms