Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms