Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms