Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rhbdd2Q8VEK2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rhbdd2Q8VEK2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms