Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn4Q8VCH8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn4Q8VCH8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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