Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh10Q8VCH7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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