Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms