Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms