Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CcsapQ8QZT2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CcsapQ8QZT2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms