Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv3Q8K424 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv3Q8K424 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms