Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms