Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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