Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms