Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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