Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms