Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms