Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn3Q8K045 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
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Pkn3Q8K045 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms