Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh4a1Q8CHT0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms