Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms