Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp27Q8CEG8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp27Q8CEG8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp27Q8CEG8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp27Q8CEG8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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