Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms