Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms