Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8CD60 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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