Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms