Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms