Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf2Q8CB19 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms