Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A430089I19RikQ8C9W1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms