Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7cQ8C6E1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7cQ8C6E1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7cQ8C6E1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7cQ8C6E1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7cQ8C6E1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7cQ8C6E1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol7cQ8C6E1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms