Protein–RNA interactions for Protein: Q8C116

Fmo9, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo9Q8C116 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmo9Q8C116 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmo9Q8C116 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms