Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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