Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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