Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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