Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms