Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms