Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6kb1Q8BSK8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms