Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms