Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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