Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ7

Cgrrf1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cgrrf1Q8BMJ7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cgrrf1Q8BMJ7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cgrrf1Q8BMJ7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cgrrf1Q8BMJ7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms