Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c2Q8BL74 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c2Q8BL74 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms