Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ubash3bQ8BGG7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ubash3bQ8BGG7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ubash3bQ8BGG7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Ubash3bQ8BGG7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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