Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms